Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCOA1Q15788 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCOA1Q15788 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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