Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EFNB3Q15768 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms