Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF1AQ15573 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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