Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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