Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms