Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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