Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SPIDRQ14159 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPIDRQ14159 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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