Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms