Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAPSNQ13702 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms