Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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