Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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GPM6BQ13491 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GPM6BQ13491 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GPM6BQ13491 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GPM6BQ13491 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPM6BQ13491 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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