Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3AQ13472 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TOP3AQ13472 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TOP3AQ13472 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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