Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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