Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRSQ13332 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms