Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHAF1BQ13112 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms