Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM32Q13049 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms