Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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