Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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