Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms