Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL1Q08397 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms