Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCN1BQ07699 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms