Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL16A1Q07092 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL16A1Q07092 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL16A1Q07092 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL16A1Q07092 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms