Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms