Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC18A2Q05940 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms