Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIN1Q05586 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms