Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN7AQ01118 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms