Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMF1P82094 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms