Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAE1P78406 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAE1P78406 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAE1P78406 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAE1P78406 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAE1P78406 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAE1P78406 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms