Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HBBP68871 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HBBP68871 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
HBBP68871 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
HBBP68871 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
HBBP68871 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms