Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms