Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms