Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms