Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCBP4P57723 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms