Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP9P55211 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP9P55211 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms