Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CRIP1P50238 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CRIP1P50238 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms