Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms