Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS4P49798 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS4P49798 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS4P49798 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS4P49798 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS4P49798 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms