Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1EP49674 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms