Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPIAP49247 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms