Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NMUP48645 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NMUP48645 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms