Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms