Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CAPGP40121 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CAPGP40121 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAPGP40121 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms