Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF2P35227 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms