Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFNP31947 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFNP31947 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFNP31947 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms