Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA6P31267 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms