Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID4AP29374 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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