Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCAP28676 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms