Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLD1P28340 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD1P28340 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD1P28340 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD1P28340 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD1P28340 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD1P28340 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLD1P28340 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms