Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NMBRP28336 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMBRP28336 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms