Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms